Modéliser la transmission et la maîtrise de la paratuberculose en troupeau bovin laitier irlandais avec un vêlage groupé printanier

Contexte et enjeux :

La paratuberculose est une infection bactérienne chronique de l'intestin des bovins causée par Mycobacterium avium sous-espèce paratuberculosis (Map). En Irlande, la dynamique de la population des troupeaux est saisonnière car les vaches en lactation sont principalement nourries au pâturage. En outre, les veaux peuvent paître dans les pâturages adjacents aux vaches ou être complètement séparés des vaches pendant la période de pâturage, ce qui influence également leur exposition à la carte. Une telle saisonnalité pourrait avoir un impact sur la propagation et le contrôle de la carte à l'échelle du troupeau. Pour aborder cette question, une approche de modélisation mécaniste est appropriée, permettant de comparer facilement les scénarios. Par conséquent, pour mieux comprendre la propagation de la carte dans les troupeaux laitiers irlandais, nous avons utilisé un modèle stochastique basé sur les individus qui tient compte de la dynamique saisonnière de la population. Ce modèle a été utilisé pour étudier la probabilité de persistance de Map dans le temps, la prévalence au sein du troupeau, l'importance relative des voies de transmission, et pour évaluer les stratégies de contrôle par test et abattage.

Résultats :

Nous avons simulé un troupeau laitier irlandais typique comptant en moyenne 82 vaches en lactation, soit 112 animaux au total. Chaque scénario a été itéré 1 000 fois pour ajuster les variations dues à la stochasticité. La carte a été introduite dans le troupeau totalement naïf par l'achat d'une vache primipare modérément infectieuse. On a considéré que l'infection persistait lorsqu'au moins un animal infecté restait dans le troupeau ou lorsque Map était présent dans l'environnement. La probabilité de persistance de la carte 15 ans après son introduction était comprise entre 32,2 et 42,7 % lorsque les veaux et les vaches étaient en contact au pâturage, et entre 18,9 et 29,4 % lorsque les veaux et les vaches étaient séparés au pâturage. Les scénarios de test et de réforme consistaient à réformer les vaches hautement positives dans les 13 ou 4 semaines suivant la détection, et à garder les veaux nés de vaches hautement positives vs à les retirer. La stratégie la plus efficace consistait à réformer les vaches hautement positives dans les quatre semaines suivant la détection. L'élimination de la progéniture des mères fortement testées positives n'a pas affecté la persistance de la carte et la prévalence au sein du troupeau. La prévalence moyenne 15 ans après l'introduction de la carte était la plus élevée (63,5 %) lorsque les veaux et les vaches étaient en contact au pâturage. La prévalence moyenne était inférieure de 15 % (diminution absolue) lorsque les vaches étaient réformées dans les 13 semaines, et de 28 % lorsqu'elles étaient réformées dans les 4 semaines.

Perspectives :

Autour du vêlage, le taux d'infection était élevé, les veaux étant infectés in utero ou via l'environnement intérieur général, les deux principales voies de transmission. Pendant le reste de l'année, le taux d'incidence était relativement faible, la plupart des veaux étant infectés au pâturage lorsqu'ils étaient en contact avec les vaches. Le dépistage et la mise à la réforme ont été une stratégie de contrôle efficace lorsqu'ils ont été utilisés avant la période de vêlage pour minimiser le nombre de vaches hautement infectieuses présentes lors de la naissance des veaux. L'évaluation de ces stratégies de contrôle devrait maintenant être étendue à l'échelle inter-troupeaux, afin de tenir compte de la diversité de la gestion des troupeaux (taille, renouvellement, etc.) et des multiples introductions de la carte dans les troupeaux en raison du commerce des animaux.

Valorisation :

Ce travail est une collaboration entre l'INRAE, Oniris Nantes et University College Dublin (UCD). Il fait partie du projet NexusMap et est financé par l'UCD.

Références bibliographiques :

Biemans, F., Ben Romdhane, R., Gontier, P., Fourichon, C., Ramsbottom, G., More, S.J., Ezanno, P., 2021. Modelling transmission and control of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis within Irish dairy herds with compact spring calving. Preventive Veterinary Medicine, 186, 105228

doi.org/10.1016/j.prevetmed.2020.105228

Aperçu schématique de la gestion du troupeau dans un troupeau laitier irlandais typique à vêlage de printemps.