APPIFISH: Antibiorésistance Pouvoir Pathogène Infectiologie chez le poisson

Contexte et Enjeux

• Importance des maladies infectieuses bactériennes en aquaculture
• Plan Ecoantibio 1&2 : volonté de réduire les intrants médicamenteux de 25%

Objectifs

• Mieux comprendre la variabilité génétique et phénotypique de bactéries pathogènes isolées au sein des élevages piscicoles,
• Mieux comprendre la persistance de l’agent infectieux dans les élevages en identifiant les réservoirs potentiels,
• Mieux comprendre les interactions immunitaires entre l’agent pathogène et son hôte.

L’objectif final est de mieux appréhender les stratégies de lutte vis-à-vis de deux bactéries Yersinia ruckeri et Flavobacterium psychrophilum en développant des moyens prophylactiques et en limitant l’usage des intrants de type antibiotique.

Espèces cibles

Bactéries ichtyopathogènes

• Yersinia ruckeri
• Aeromonas spp.
• Flavobacterium psychrophilum

Champs d’application

• Aquaculture (truite arc en ciel)
• Maladies bactériennes des poissons d’élevage
• Antibio-résistance
• Variabilité génétique bactérienne

Expertise et compétences

• Bactériologie
• Physiopathologie
• Immunologie
• Épidémiologie
• Pharmacologie

Projets en cours

• Enr-EAU-bage : Création d'un guide de bonnes pratiques adapté à la réalisation de l'enrobage d'antibiotique sur l'aliment en fermes piscicoles
• EPIRESIST-MEHTYLR : Epigénome de bactéries isolées d'environnements piscicoles et son évolution lors d'une exposition prolongée à des contaminants chimiques non antibiotiques
• MARCOPOLO : MAcRobraChium Opportunités Pays de la LOire
• OPTICED : OPTImisation de la Crevetticulture d’Eau Douce
• Pour-SANG-tage : Établissement d'un référentiel pour la réalisation de prises de sang sur les salmonidés en expérimentation animale
• VacEasy : Promouvoir la vaccination dans les élevages piscicoles en évaluant des formules et des protocoles vaccinaux améliorant la faisabilité technique

Membres de l'équipe

Cadres scientifiques :

• Ségolène Calvez (MC DGER, Resp. Équipe)
• Emmanuelle Moreau (PR DGER)
• Nora Navarro-Gonzalez (MC)
• Kenny Oberlé (MC)
• Hervé Pouliquen (PR)
• Antoine Rostang (MC)

Appui scientifique et technique

• Céline David (TR)
• Lionel Pineau (TR)

Doctorants et contractuels

• Houssem Ben Yahia (PostDoc)