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L’antibiorésistance (ABR) pose un défi mondial qui concerne la santé et la sécurité alimentaire. L’aquaculture, en particulier, est considérée comme un «hotspot» de bactéries et de gènes d’ABR. Ainsi les experts ont signalé récemment le manque de connaissances sur l’ABR en aquaculture en Europe et réclament le suivi de l’ABR dans l’eau.

Description du projet

L’objectif est de décrire la dynamique de l’ABR dans deux systèmes aquacoles complexes : l’élevage de poissons en système ouvert et en système à eau recirculée. Les hypothèses principales sont : 1) l’eau et l’aliment sont sources d’ABR, et 2) l’ABR persiste dans les deux systèmes. Quatre élevages piscicoles seront recrutés, dont deux en système recirculé et deux en système ouvert, et pour chaque l’un en amont et l’autre en aval d’une station d’épuration. Nous allons prélever l’eau, le sédiment et les biofilms aux points clés de la ferme, ainsi que l’aliment. Une combinaison de méthodes culturales et moléculaires sera utilisée pour obtenir une vision globale de l’ABR. Les résultats contribueront à l’analyse de risque de dissémination de l’ABR dans l’environnement aquatique et à l’identification des points critiques de contrôle.

Partenaires

  • Maykel Hernández Mesa, Universidad de Granada, Spain
  • Marta Pérez Sancho, laboratorio VISAVET, Universidad Complutense de Madrid, Spain
  • Thomas Brauge, ANSES Boulogne-sur-Mer
  • Corinna Kehrenberg, Justus-Liebig University Giessen, Germany

Personnes impliquées dans l'unité

Nora Navarro-Gonzalez, Segolene Calvez, Lionel Pineau, Celine David, Houssem Ben Yahia (postdoc), Sarah Ochoa (doctorante), Anne Lehebel, Nadine Brisseau

Personne à contacter

Nora Navarro-Gonzalez

Résultats

Trois manuscrits scientifiques sont en cours de rédaction.

Les résultats préliminaires ont été présentés lors de plusieurs congrès internationaux, ainsi qu’un colloque national :

Ochoa S, David C, Bachelet F, Pineau L, Perez-Sancho M, Ben Yahia H, Kehrenberg C, Calvez S, Navarro-Gonzalez N (2025) Tracking trouble: sources, persistence, and risk factors of antimicrobial-resistant Escherichia spp in freshwater fish farms of north-west France. European Association of Fish Pathlogists, Heraklion (Greece). Oral communication

Navarro-Gonzalez N, Ochoa S (2025) Assessment of fecal pollution in the freshwater fish farm environment and first insight into antimicrobial resistance. Cell S Marin, Nantes (France). Oral communication

A. Narváez-Simón, S. Ochoa, A. M. García-Campaña, N. Navarro-González, M. Hernández-Mesa (2025) Quantification of antibiotics in aquaculture waters using SPLC-HRMS: Integrating One Health insights. Euroanalysis, Barcelona (Spain). Poster

Ben Yahia H, Ochoa S, David C, Bachelet F, Pineau L, Calvez S, Navarro-Gonzalez N (2024) Sources and persistence of fecal bacteria and antimicrobial resistance in freshwater fish farms from North-West France. Aqua 2024, Copenhaguen (Denmark). Oral communication

Liens

Sarah Ochoa, doctorante BIOEPAR :

https://bioepar.angers-nantes.hub.inrae.fr/l-unite/annuaire2/membres-o/ochoa-sarah

Houssem Ben Yahia, postdoc à BIOEPAR:

https://bioepar.angers-nantes.hub.inrae.fr/l-unite/annuaire2/anciens-membres/anciens-2025

Participation du projet à la Fête de la Science :

https://bioepar.angers-nantes.hub.inrae.fr/communication/faits-marquants/faits-marquants-2024/l-antibioresistance-en-aquaculture

Autres informations

Intervention à Pint of Science et DECLICS.

Conférence lors de la journée scientifique du jumelage Nantes-Giessen à Giessen, Allemagne (public : étudiants en vétérinaire allemands et français).

Séminaire scientifique au centre de recherche VISAVET (Madrid, Espagne), pour un public scientifique et personnel technique.

Séminaire scientifique à l’Université Autonome de Barcelona (Espagne) pour les doctorants du programme « Médecine et Santé Animales »

Date de modification : 24 avril 2026 | Date de création : 24 avril 2026 | Rédaction : NNG