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Introduction

Les affections respiratoires d'origine infectieuse représentent 70 à 80 % des problèmes de santé dans les ateliers d'engraissement pour jeunes bovins (JB). Elles sont provoquées par des virus pathogènes des voies respiratoires qui font la place à des surinfections bactériennes. L'identification des agents responsables des troubles est utile au choix argumenté de mesures préventives et curatives appropriées. En pratique, le prélèvement d'échantillons dans les voies respiratoires pour la recherche et l'identification des agents pathogènes responsables des maladies respiratoires est peu réalisé car il est difficile à mettre en œuvre et invasif.

Description du projet

Le projet AIDAV, démarré en janvier 2022, vise à développer une méthode d'échantillonnage non invasive basée et fondée sur le prélèvement de l'air expiré , et son couplage avec une technique d'analyse sensible et rapide par amplification biomoléculaire isotherme (LAMP) à l'aide d'un dispositif microfluidique automatisé pour la détection des virus respiratoires chez les bovins, en mettant l'accent pour commencer sur le coronavirus bovin.

Le projet a débuté par des tests préliminaires en laboratoires et s'est poursuivi par des tests intermédiaires en station expérimentale en juillet 2022 et septembre 2023. L'évaluation en élevage débute à l'hiver 2023/2024.

Partenaires

AIDAV implique la collaboration de plusieurs entités académiques et privées, dont le CEA (Jean-Maxime Roux et Guillaume Blaire), l'INRAE (Sébastien Assié et Gilles Foucras), et l'IDELE (Elise Vanbergue).

Personnes impliquées dans l'unité

Sébastien Assié (Oniris/INRAE)

Personne à contacter

Sébastien Assié est le coordinateur du projet et sert de contact principal (sebastien.assie@oniris-nantes.fr) pour toute information complémentaire concernant AIDAV.

Résultats

Jusqu'à présent, le projet a réalisé des avancées importantes. Les résultats préliminaires montrent que l'approche non invasive de prélèvement et d'identification rapide des virus est efficace, avec une détection réussie du coronavirus bovin chez les veaux expérimentalement infectés. Le système de collecte a gagné en robustesse et fait l'objet d'une reprise par un équipementier. Les cartes microfluidiques ont gagné en performance entre les deux essais en station expérimentale.

Photo 1 : L'appareil de collecte et l'insertion d'une carte microfluidique (version début 2024)

Photo 2 : L'insertion d'une carte microfluidique sur laquelle la capture des particules est réalisée et une détection par LAMP du coronavirus bovin est réalisée (version début 2024)

Photo 3 : L'essai en conditions expérimentales, prélèvement d'air ambiant et mise en évidence du coronavirus bovin dans l'air partagé par 3 veaux infectés expérimentalement.