Ezanno Pauline

J’ai obtenu mon doctorat (MontpellierSupAgro & Univ. Montpellier) en biologie intégrative en 2002. Recrutée en 2003 comme chargée de recherche INRAE dans l’unité BIOEPAR à Nantes, je conduis des travaux de recherche en modélisation mécaniste en épidémiologie animale et dynamique de populations. L’objectif de mes travaux de recherche est de mieux comprendre et prédire la propagation multi-échelles d'agents pathogènes et la dynamique spatio-temporelle de populations d’hôtes et de vecteurs. J’ai obtenu mon HDR (Habilitation à Diriger des Recherches) en 2010. Directrice de recherche depuis 2015, je suis responsable de l’équipe DYNAMO regroupant les modélisateurs de BIOEPAR. De 2012 à 2017, j’ai coordonné un Projet Investissements d’Avenir (www.inrae.fr/mihmes/) associant INRAE, Oniris, ANSES, INRIA, IRMAR et une équipe de l’Institut Vétérinaire de Suède (SVA). J’ai contribué au développement de deux logiciels dédiés aux gestionnaires de la santé qui ont reçu chacun un prix d’innovation (Innov’Space 2015 & 2016). J'ai piloté un challenge de modélisation international sur la peste porcine africaine. J'ai également été responsable de volets de recherche dans 5 projets nationaux, s'intéressant aux mouvements commerciaux du bétail, à la dynamique de population de vecteurs et à la dynamique épidémique de maladies vectorielles, ou encore à la hiérarchisation de stratégies de maîtrise des maladies animales infectieuses. Depuis 2021, je co-pilote le WP2 modélisation dans le projet H2020 DECIDE (https://decideproject.eu/) qui porte sur le développement d'outils pour une gestion et une priorisation basées sur les données de maladies animales contagieuses endémiques en Europe. Depuis Mai 2023, je suis co-coordinatrice du projet Horizon Europe WiLiMan-ID (ecology of wildlife, livestock, human and infectious diseases in changing environments), dans lequel je pilote le WP "interactions among pathogens, hosts, vectors and the environment: role in infectious diseases emergence, spread and persistence". Par ailleurs, j'ai co-organisé les deux éditions du congrès "Modelling in Animal Health" (2017, 2021). Je forme aussi de nombreux étudiants (doctorat, master, etc.) et contribue à l’enseignement supérieur et à la formation continue dans mon domaine d’expertise. Enfin, je suis l’auteur de plus de 90 articles scientifiques et articles longs de conférence.

Thèmes de recherche

• Modélisation mécaniste stochastique
• Epidémiologie animale et dynamique de populations
• Processus multi-échelles : intra-hôte, population, métapopulation
• Analyse numérique de modèles de simulation
• Evaluation de stratégies de maîtrise ciblées

Liens

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Publications récentes

• Biemans F., Arnoux S., More S.J., Tratalos J.A., Gavey L., Ezanno P. 2022. The effect of risk-based trading and within-herd measures on Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis spread within and between Irish dairy herds. Prev Vet Med 209:105779. https://doi.org/10.1016/j.prevetmed.2022.105779
• Biemans F., Tratalos J., Arnoux S., Ramsbottom G., More S., Ezanno P. 2022. Modelling transmission of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis between Irish dairy herds. Vet Res 53:45. https://doi.org/10.1186/s13567-022-01066-5
• Cecilia H., Drouin A., Métras R., Balenghien T., Durand B., Chevalier V., Ezanno P. 2022. Mechanistic models of Rift Valley fever virus transmission dynamics: a systematic review. PLoS Negl Trop Dis 16(11):e0010339. https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0010339
• Cecilia H., Vriens R., Schreur P.W., de Wit M., Métras R., Ezanno P., ten Bosch Q.  2022. Heterogeneity of Rift valley fever virus transmission potential across livestock hosts, quantified through a model-based analysis of host viral load and vector infection. PLoS Comput Biol 18(7): e1010314. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1010314
• Cristancho L., Ezanno P., Vergu E. 2022. Dynamic resource allocation for controlling pathogen spread on a large animal metapopulation network. J R Soc Interface 19: 20210744. https://doi.org/10.1098/rsif.2021.0744
• Cristancho-Fajardo L., Vergu E., Beaunée G., Arnoux S., Ezanno P. 2022. Learning and strategic imitation in modelling farmers’ dynamic decisions on Bovine Viral Diarrhoea vaccination. Veterinary Research 53:102. https://doi.org/10.1186/s13567‑022‑01112‑2
• Ezanno P., Arnoux S., Joly A., Vermesse R. 2022. Rewiring cattle trade movements helps to control bovine paratuberculosis at a regional scale. Prev Vet Med 198:105529. https://doi.org/10.1016/j.prevetmed.2021.105529
• Ezanno P., Picault S., Bareille S., Beaunée G., Boender G.J., Dankwa E.A., Deslandes F., Donnelly C.A., Hagenaars T.J., Hayes S., Jori F., Lambert S., Mancini M., Munoz F., Pleydell D.R.J., Thompson R.N., Vergu E., Vignes M., Vergne T. 2022. The African swine fever modelling challenge: model comparison and lessons learnt. Epidemics 40, 100615. https://doi.org/10.1016/j.epidem.2022.100615
• Picault S., Ezanno P., Smith K., Amrine D., White B., Assié S. 2022. Modelling contrasted fattening systems in Europe and the USA and their impact on Bovine Respiratory Disease burden. Vet Res 53:77. https://doi.org/10.1186/s13567-022-01094-1
• Picault S., Vergne T., Mancini M., Bareille S., Ezanno P. 2022. The African swine fever modelling challenge: objectives, model description and synthetic data. Epidemics 40, 100616. https://doi.org/10.1016/j.epidem.2022.100616
• Arnoux S., Bidan F., Damman A., Petit E., Assié S., Ezanno P. 2021. To vaccinate or not: impact of bovine viral diarrhoea in French cow-calf herds. Vaccines 9(10), 1137. https://doi.org/10.3390/vaccines9101137
• Biemans F., Ben Romdhane R., Gontier P., Fourichon C., Ramsbottom G., More S. J., Ezanno P. 2021. Modelling transmission and control of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis within Irish dairy herds with compact spring calving. Prev Vet Med 186:105228. DOI: 10.1016/j.prevetmed.2020.105228.
• Cecilia H., Arnoux S., Picault S., Dicko A., Seck M. T., Sall B., Bassène M., Vreysen M., Pagabeleguem S., Bancé A., Bouyer J., Ezanno P. 2021. Dispersal in heterogeneous environments drives population dynamics and control of tsetse flies. Proc R Soc B 288(1944):20202810 DOI: 10.1098/rspb.2020.2810.
• Cristancho Fajardo L., Ezanno P., Vergu E. 2021. Integrative modelling of pathogen spread through animal trade by accounting for farmers’ control decisions. Sci Rep 11:9581 https://doi.org/10.1038/s41598-021-88471-6
• Ezanno P., Picault S., Beaunée G., Bailly X., Muñoz F., Duboz R., Monod H., Guégan J.-F. 2021. Research perspectives on animal health in the era of artificial intelligence. Vet Res 52(1):40 DOI: 10.1186/s13567-021-00902-4.
• Morel-Journel T., Assié S., Vergu E., Mercier J.-B., Bonnet-Beaugrand F., Ezanno P. 2021. Minimizing the number of origins in batches of weaned calves to reduce their risks of developing bovine respiratory diseases. Vet Res 52(1):5 DOI: 10.1186/s13567-020-00872-z.
• Morel-Journel T., Vergu E., Mercier J. B., Bareille N., Ezanno P. 2021. Selecting sorting centres to avoid long distance transport of weaned beef calves. Sci Rep 11(1):1289 DOI: 10.1038/s41598-020-79844-4.
• Cecilia H., Métras R., Fall A. G., Lo M. M., Lancelot R., Ezanno P. 2020. It's risky to wander in September: modelling the epidemic potential of Rift Valley fever in a Sahelian setting. Epidemics, 33:100409 DOI: 10.1016/j.epidem.2020.100409.
• Ezanno P., Andraud M., Beaunée G., Hoch T., Krebs S., Rault A., Touzeau S., Vergu E., Widgren S. 2020. How mechanistic modelling supports decision making for the control of enzootic infectious diseases. Epidemics, 32:100398. DOI: 10.1016/j.epidem.2020.100398.
• Lupo C., Dutta B.L., Petton S., Ezanno P., Tourbiez D., Travers M-A., Pernet F., Bacher C. 2020. Spatial epidemiological modelling of infection by Vibrio aestuarianus shows that connectivity and temperature control oyster mortality. Aqua Envir Interact 12, 511-527, https://doi.org/10.3354/aei00379
• Parlavantzas N., Pham L.M., Morin C., Arnoux S., Beaunée G., Qi L., Gontier P., Ezanno P. 2020. A service-based framework for building and executing epidemic simulation applications in the cloud. Concurrency and Computation: Practice and Experience, 32(5):e5554 https://doi.org/10.1002/cpe.5554
• Cecilia H., Arnoux S., Picault S., Dicko A., Seck M.T., Sall B., Bassène M., Vreysen M., Pagabeleguem S., Bancé A., Bouyer J., Ezanno P. 2019. Environmental heterogeneity drives tsetse fly population dynamics and control. bioRxiv, https://doi.org/10.1101/493650, ver. 3 peer-reviewed and recommended by PCI Ecology (https://dx.doi.org/10.24072/pci.ecology.100024)
• Picault S., Huang Y.-L., Sicard V., Arnoux S., Beaunée G., Ezanno P. 2019. EMULSION: transparent and flexible multiscale stochastic models in human, animal and plant epidemiology. PLoS Comput Biol 15(9):e1007342 https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007342
• Lupo C., Travers M.A., Tourbiez D., Barthélémy C.F., Beaunée G., Ezanno P. 2019. Modeling the transmission of Vibrio aestuarianus in Pacific oysters, Crassostrea gigas, using experimental infection data. Front Vet Sci 6:142, https://dx.doi.org/10.3389/fvets.2019.00142
• Qi L., Beaunée G., Arnoux S., Dutta B.L., Joly A., Vergu E., Ezanno P. 2019. Neighbourhood contacts and trade movements drive the regional spread of bovine viral diarrhoea virus (BVDV). Vet Res 50:30 https://doi.org/10.1186/s13567-019-0647-x
• Camanes G., Joly A., Fourichon C., Ben Romdhane R., Ezanno P. 2018. Control measures to prevent the increase of paratuberculosis prevalence in dairy cattle herds: an individual-based modelling approach. Vet Res 49(1):60, https://doi.org/10.1186/s13567-018-0557-3
• Hoch T., Touzeau S., Viet A.-F., Ezanno P. 2018. Between-group pathogen transmission: From processes to modeling. Ecol Modell 383:138-149, https://dx.doi.org/10.1016/j.ecolmodel.2018.05.016
• Lambert S., Ezanno P., Garel M., Gilot-Fromont E. 2018. Stochasticity drives epidemiological patterns in wildlife with implications for diseases and population management. Sci Rep 8:16846 https://doi.org/10.1038/s41598-018-34623-0
• Viet A-F., Krebs S., Rat-Aspert O., Jeanpierre L., Belloc C., Ezanno P. 2018. A modelling framework based on MDP to coordinate farmers' disease control decisions at a regional scale. PLoS ONE 13(6):e0197612 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0197612
• Beaunée G., Vergu E., Joly A., Ezanno P. 2017. Controlling bovine paratuberculosis at a regional scale: towards a decision modeling tool. J Theor Biol 435:157-183 doi: 10.1016/j.jtbi.2017.09.012.
• Ben Romdhane R., Beaunée G., Camanes G., Guatteo R., Fourichon C., Ezanno P. 2017. Which phenotypic traits of resistance should be improved in cattle to control paratuberculosis dynamics in a dairy herd: a modelling approach. Vet Res 48(1):62, https://doi.org/10.1186/s13567-017-0468-8