OFFRE D’EMPLOI : Ingénieur (H/F) développement logiciel

Ingénieur (H/F) développement logiciel Modèles épidémiologiques à large échelle

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec plus de 270 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal, et en écologie-environnement. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous exercerez votre activité au sein de l’équipe DYNAMO dans l’unité de recherche BIOEPAR (INRAE / Oniris), en collaboration avec l’équipe EPIDESA (IHAP, Toulouse). Votre travail s’inscrira dans le contexte du projet Horizon Europe WiLiMan-ID (https://www.wiliman-id.eu/) 
Votre mission consistera à adapter et optimiser un ou plusieurs modèles mécanistes de transmission de la peste porcine africaine (PPA) de façon à permettre l’exploration de scénarios de surveillance de cette maladie à large échelle. Le virus de la PPA, circulant entre espèces de suidés, est responsable d’épidémies importantes en Asie, en Europe de l’Est et tout récemment en Espagne, et fait peser une menace grave sur les élevages de porcs domestiques. Plusieurs modèles ont été développés mais nécessitent des adaptations et des optimisations logicielles pour pouvoir être déployés à l’échelle régionale dans un cadre réaliste, en termes de paysages, de densités de sangliers et de contraintes pratiques de surveillance.

Vous serez plus particulièrement en charge de :

1.    définir un cahier des charges à partir des hypothèses biologiques retenues dans le modèle visé ;
2.    analyser les modèles existants pour réutiliser ce qui peut l’être ;
3.    identifier les architectures de simulation et le langage de programmation les plus pertinents pour la performance des simulations mais aussi pour la réutilisabilité du modèle et la capitalisation de compétences dans l’équipe ;
4.    développer, tester et déployer le simulateur ;
5.    assurer des développements génériques pour faciliter une adaptation à d’autres contextes épidémiologiques ou l’amélioration logicielle d’outils existants.
 

Formation et compétences recherchées

Formation recommandée : diplôme d’ingénieur, master 2 ou équivalent en informatique 
 

Connaissances souhaitées : 
•    expérience solide en programmation orientée objets, Python 3, R et langages compilés (C++, Go…).
•    bonnes connaissances en ingénierie logicielle, design patterns, bonnes pratiques de développement.
•    bonne connaissance des systèmes Linux (notamment en ligne de commande) ;
•    une connaissances des architectures de simulation ECS serait un plus.
 

Expérience appréciée :
•    expérience en optimisation de code ou architectures de calcul haute performance (notamment clusters) ;
•    expérience en développement de modèles ou de simulateurs ;
•    expérience de systèmes d’information géographiques.
Aptitudes recherchées : 
•    compétences rédactionnelles et pédagogiques pour interagir avec des scientifiques non-informaticiens ;
•    maîtrise de l’anglais (niveau courant) et des techniques de présentation écrite et orale ;
•    autonomie, initiative et rigueur ; bon esprit d’analyse et de synthèse ;
•    capacité à travailler en équipe et plus particulièrement dans un milieu scientifique pluridisciplinaire ;
•    intérêt pour la modélisation, l’épidémiologie, la santé animale.
 

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous pourrez bénéficier selon le type de contrat :

- jusqu’à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

 Modalités d’accueil

 Nom de l’unité d’accueil : BIOEPAR
 Code postal + ville du lieu d’exercice : 44300 Nantes
 Type de contrat : CDD
 Durée du contrat : 12 mois
 Date d’entrée en fonction : dès que possible
 Rémunération : entre 2 244€ et 3 332€ (brut mensuel) selon expérience

Modalités pour postuler

 Merci de transmettre une lettre de motivation et un CV. Par e-mail :

 sebastien.picault@inrae.fr, gael.beaunee@inrae.fr

 -> Date limite pour postuler : 01/07/2026