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Résumé de la thèse :

Pratiquée dans toutes les filières d’élevage de rente, l’antibiothérapie suscite une attention particulière en pisciculture. En effet, il est légitime de s’interroger sur la contamination de l’environnement récepteur des effluents piscicoles par les antibiotiques utilisés et les bactéries résistantes.L’objectif de nos travaux était d’étudier l’influence d’élevages piscicoles présents le long d’un cours d’eau, sur les proportions de résistance d’Aeromonadaceae aux antibiotiques utilisés en pisciculture. Encore rare chez les bactéries pathogènes des poissons, la résistance acquise au florfénicol, un antibiotique d’utilisation récente en pisciculture, a été recherchée afin d’être caractérisée génétiquement. De manière générale, les proportions d’Aeromonas résistants à l’acide oxolinique, l’oxytétracycline et l’association sulfaméthoxazole-triméthoprime, étaient souvent accrues dans les sédiments prélevés en aval direct des effluents de quatre piscicultures et d’une station d’épuration. Cette contamination n’était pas systématiquement en relation avec la présence des antibiotiques, également constatée en aval de certaines des piscicultures étudiées. La résistance au florfénicol est apparue rare chez les Aeromonas, puisque seuls deux clones résistants ont pu être isolés. Leur diffusion et leur persistance ont été montrées. Chez un clone d’A. bestiarum, la résistance au florfénicol était due à un plasmide conjugatif porteur à la fois du gène floR et de gènes de résistance à la tétracycline, aux sulfamides et à la streptomycine, situés à proximité d’un élément ISCR2 qui pourrait être impliqué dans leur mobilité. Les résultats indiquent tout d’abord la complémentarité des méthodes chimiques et microbiologiques pour évaluer l’impact de l’utilisation d’antibiotiques en milieu aquatique, et ensuite que les conditions sont réunies pour une diffusion de la résistance acquise au florfénicol, qui devrait donc être surveillée.Français